J'ai envie de te dire qu'il est toujours mieux de laisser les petits aux parents, car ils savent d'instinct comment s'en occuper. Mais si en prenant les petits lorsque les parents ne sont pas dans le nid, c'est toujours moins perturbant pour eux, surtout en ce qui concerne leur confiance en toi et leur stress.
Pour cette couvée en tout cas, je ne prendrais pas le risque de retirer le petit qui reste, car l'autre est déjà mort. Tu ne sais pas ce qu'il a eu, et il serait dommage de perturber le second, s'il est également fragile. A ta place j'interviendrais le moins possible sur cette couvée-ci au moins.